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對於雨停了水淹更高，經濟部水利署長賴建信分析，嘉義地勢低漥，降雨加上大潮，在潮汐影響下積水退得特別慢。除了嘉義，雲林以及彰化地區同樣處於嚴重地層下陷狀態，均肇因於幾十年來農漁民超抽地下水。水利署調查，歷經 10 年努力，雖然全台地層下陷面積減少 411 平方公里，目前仍有多達 2491 平方公里的土地下陷中，又以雲林 855 平方公里狀況最嚴重。
▲即使經過 10 年努力，全台仍有近 2500 平方公里國土面臨地層下陷危機。（圖／經濟部水利署提供）據了解，為了減緩地層下陷危機，近 10 年來政府明令農漁民停抽地下水並封井，不過沿海養殖魚塭仍偷偷抽水並引入海水。更有知情人士透露，這波 823 淹水災情，政府一方面出動大型抽水機希望加速退水，但當地漁民擔心魚跑掉、死掉影響生計，又逆向將水抽回，導致退水難度更高。
賴建信指出，透過封鎖深井、改善耕作制度等方式控制地下水抽水量，配合減少土壤荷重（高鐵沿線禁限建、東西快速道路陸基改懸壁式等），雖然地層下陷面積減少，不過以全台近 2500 平方公里土地下陷計算，比例少得可憐。
面對沉入海中的國土，賴建信坦言，地層下陷問題只能控制，無法明顯改善，情勢已不可逆轉。他有感而發，台灣是我們生長的土地，這片鄉土值得大家珍視，希望在工程手段之外，民眾也能配合《國土計畫法》上路後的管理措施，共同面對氣候變遷帶來的嚴峻考驗，建立「耐災型」社會，即使淹水，也能淹得不深、淹得不長。
