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蘇聯在1979年12月入侵阿富汗，在阿富汗建立魁儡政府，還派出軍機追擊躲藏在阿富汗與巴基斯坦邊界的反政府游擊隊，為了對抗紅軍戰機，美國除提供阿富汗游擊隊肩射型刺針防空飛彈，也開始提供巴基斯坦F-16戰機，讓巴國成為最早使用F-16戰機的國家之一，也是繼以色列之後第二個將F-16用於實戰的國家。
從1983年至1987年，巴基斯坦從美國獲得了40架F-16A/B Block 15戰鬥機，巴基斯坦的F-16曾擊落入侵的Su-22戰機、Su-25攻擊機、MiG-23、An-26運輸機、Mi-8直升機等各型蘇聯戰機，僅有一架F-16被友軍誤擊所擊落。
隨著蘇聯撤離阿富汗，以及巴基斯坦開始發展核武，美巴戰略矛盾開始顯露出來，美國在1990年凍結交付巴國28架F-16A/B戰鬥機，並拒絕歸還購機款。這批被美國扣留的F-16戰機引發美巴外交爭執，美國曾向印尼、菲律賓推銷這批戰機，來換取現金賠償巴基斯坦，但是印尼跟菲國最後都沒有採購。
2001年911事件爆發後，美國需要巴國協助對阿富汗作戰，於2005年至2008年交付給巴基斯坦這批被扣留的戰機中的14架。2006年，美國軍援了12架F-16C與6架F-16D Block 52+戰機，總計巴基斯坦空軍現有F-16A/B/C/D型戰機共76架。
▲巴基斯坦派出F-16飛官與地勤人員前往美國受訓。（圖／美國空軍）印度指控巴基斯坦在2月27日派出F-16攻擊印度空軍，馬上遭到巴國否認，印度還拿出AIM-120先進中程空對空飛彈殘骸零件，企圖證明巴國曾出動F-16戰機，又再度引發印巴口水戰，還意外牽扯到也使用AIM-120飛彈的我國空軍。
印巴衝突會從空戰變成口水戰，主因為美國與巴基斯坦之間簽署F-16的「最終使用者協議」（end-user agreements），美國交付巴國F-16戰機條件是只能用於「反恐」與「自衛」用途，不能用作為攻擊用途。巴國是否出動F-16參與印巴空戰，違反協議，華府將展開調查。
關於F-16還有一件可能也令巴基斯坦感到無法置信，F-16製造商洛克希德馬丁公司積極參與印度百架戰機競標，印度升級型的F-16稱為F-21，還打算在印度設立生產線。如果印度採購F-16戰機，未來印巴空戰恐會出現巴基斯坦的美國製F-16對抗印度製F-16的奇特局面。
