先前開放移工入境後，大量移工湧入一般旅館居家檢疫，台北市副市長黃珊珊反對一般旅館收治這些居家檢疫者，因為會造成一般旅客、住客混居的現象，對此，遭到中央流行疫情指揮中心再次反駁。
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中央流行疫情指揮中心社區防疫組副組長楊靖慧表示，依照目前科學證據可以知道，新冠肺炎病毒不會經由空調，傳到另外的房間，只要有獨立衛浴，讓居家檢疫者可以好好待滿14天，不管是家中還是一般旅館都可以，一般旅館只要確認進去消毒的人員，都有適當防護，有達成標準防護措施即可。
楊靖慧提到，目前全台防疫旅館才8000多個房間，光是台北、新北、高雄，佔床率就超過80％，因此很多民眾沒辦法入住，所以沒道理說，在一般旅館不能居家檢疫，只要能夠把防疫旅宿做好隔離。
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發言人莊人祥也表示，以法源來看，「居家檢疫」中「家」的規定是居住所，目的住進去後不要出來、一人一室， 就可以做為居家檢疫的場所。另外，針對一般旅館的管理，指揮中心訂了相關措施「旅宿管理消毒注意事項」，定案後會統一公佈，並且請地方政府協助管理。
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