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2月12日凌晨4點45分，監獄內又傳出20多聲槍響，4名嫌犯分別是黃顯勝、魏良穎、靳竹生、黃子晏持長槍飲彈自盡。
2月12日凌晨5點35分，監所人員透過監視器確認，證實4名嫌犯自殺身亡。
2月12日凌晨5點40分，另2名歹徒鄭立德、秦義明先對四人補槍再也自殺，遭挾持典獄長平安獲釋，在警政署長王卓鈞帶領下現身。
2月12日上午7點許，副典獄長表示，犯人一開始就抱著必死決心。
高雄地檢署主任檢察官陳俊秀表示，這6名犯人從一開始就不是要表達對獄政、對刑度、對陳水扁有所不滿才做出挾持行為，他們本來就是要越獄，越獄不成被逼回去；他說，這6名受刑人用透過對社會的不滿來包裝。
2月24日，高雄監獄越獄案驗屍報告出爐，指出6名囚犯都是舉槍自盡，非加工的槍擊傷造成，檢方表示，6人的手掌、虎口處，都驗出火藥反應，且在其中一名囚犯秦義明所持的手槍上，驗出秦義明及黃子晏的DNA，證實黃子晏自盡前曾將一把無子彈的槍，交付給典獄長陳世志，再與秦義明供持一把槍自盡。
9月30日偵結，認定6名囚犯已經飲彈輕生不起訴，而時任典獄長陳世志及副典獄長賴政榮，因遭挾持的過程中生命受到威脅，才答應求犯要求，指示部屬派車給嫌犯，但囚犯最終沒有成功脫逃，因此也不起訴。
