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經調查，2名個案均無相關疫苗接種史，花蓮個案在潛伏期間曾有桃園、苗栗地區活動史，住家附近也有水稻田；南投個案住家及職場附近分別發現鴿舍及養豬場。
根據疾管署統計，今年以來，日本腦炎已陸續在各地傳出疫情，其中高雄市及彰化縣各3例，屏東縣、桃園市及嘉義縣各2例，台南市、新北市、南投縣及花蓮縣各1例。
疾管署副署長莊人祥表示，國內近5年同期確定病例數，介於12至26例，且除了離島之外，近年來各縣市幾乎都有出現確定病例，多為散發病例，其中以40歲以上成人居多。
疾管署提醒，患者感染日本腦炎後大多無症狀，少數會有頭痛、發燒或無菌性腦膜炎等症狀，嚴重則可能出現急性腦炎、精神、神經性後遺症，甚至死亡，接種疫苗是預防日本腦炎最有效的方法；台灣以三斑家蚊為主要病媒蚊，應避免於黃昏、黎明等病媒蚊吸血高峰，在豬舍或病媒蚊孳生地點等高風險環境附近活動。
