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對於蔡煌瑯的指控，柯文哲指出，萬大線標案在招標的時候會排除國內廠商是有很多因素的，第一，每個招標有它的時辰，如果不在時辰內弄好，將來萬大線的工程必定會延宕，就像機場捷運，一個工程花了20年；第二，目前北捷5條捷運線，卻擁有四套機電系統，並沒有全部統一，所以他當時主張，如果台灣未來還要做軌道運輸，應該把系統統一，才有辦法有計畫的升級系統。
至於會不會因此與民進黨失和，柯文哲說，這是北市府跟交通部開很多次會的結果，現在的北市捷運工程已經花了六千五百億，但當時沒有統一的計畫，導致機電系統亂七八糟，更不用說建立本土的軌道運輸產業；而未來的工程預計還要再花六千億，除了要整合，也應該要慢慢提升本土產業，所以結論就是「不能一次承包給你，應該慢慢提升。」
柯文哲認為，蔡煌瑯是很希望本土產業能一步登天，但是捷運工程局不肯，因為一個沒經驗廠商負責全部統包工程，這對捷運局來說風險太大，而他們不願意承擔這樣的風險，所以他基本上還是支持捷運工程局的專業判斷，但是國車國造這問題還是要大家從長計議，並整體規畫。
