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曾銘宗再指出，台大教授中有 94% 跟台大校長當選人管中閔一樣，都採事後追認，但管中閔卻因為這樣不能就任校長，這樣符合比例原則嗎？蔡碧仲則回應，就算這百分之九十幾是社會普遍存在的現象、是社會情理，但還是有一部分是違法的。他說，以前都是先上車後補票，但是 105 年有了「彭文正條款」後，都必須經過學校同意才能兼職。蔡碧仲也認為，不能彭文正一套標準、管中閔又是另一套標準。
但曾銘宗反駁蔡碧仲，指稱教育部長吳茂昆兼任基金會也沒跟學校報備，這不就違法了嗎？蔡碧仲則說「吳茂昆違法，不代表管中閔同樣可以違法」，並以六合彩舉例「沒被抓到不代表沒違法。」蔡碧仲最後強調，他只是個「政務次長」，奉命去參加跨部會會議，會議中他完全憑專業提供意見。
不過網友卻質疑蔡碧仲才是雙重標準，留言「所以蔡次長也承認吳部長違法了？」「蔡碧仲認證吳茂昆違法」、「吳違法為啥還當教育部長？」「意思是我就故意不抓另一個違法的」、「一樣違法管不能當校長，吳可以當部長？」「這就是人治思想啊，他犯法我不管，我就是故意只弄你」。
