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另外，有關一般設備設施折舊及攤銷，桃捷公司均依會計作業準則，納入損益結算；至於捷運系統重置費用，則依據交通部公營大眾捷運股份有限公司設置管理條例第15條規定，重置費用至營運第六年開始編列。今年是桃捷公司營運第二年，依規定免編列重置費用。
而有關桃捷公司營運前因中央延宕通車所造成虧損12.87億元，桃捷公司表示，已與交通部完成協商，交通部同意將機場捷運包括A8長庚醫院站、A9林口站及A19桃園體育園區站等土地開發效益的資產轉移市府，彌補機捷之前延宕通車的虧損，估計所移轉之資產價值超過12.87億元。目前交通部已將本案簽報行政院核定中。
桃捷公司指出，機捷線於106年3月2日正式通車營運，106年損益結算（盈餘）為1.18億元；107年上半年損益結算，實際純益（盈餘）為2.2億元。損益結算均經會計師簽證，經董事會決議，提送股東常會承認。
另依據公營大眾捷運股份有限公司設置管理條例第15條規定，產權屬政府所有之大眾捷運系統財產，由政府以出租方式提供捷運公司使用。桃捷公司已於105年4月27日與交通部高速鐵路工程局（現為鐵道局）簽訂租賃契約，包含土地、建物、系統及設備等，租賃契約書自營運日起生效，租賃期間共計二年，每年租金為1,000元整。待鐵道局完成產權移轉計畫，桃捷公司後續將於資產負債表揭露代管財產總值。
