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由於中油第三天然氣接收站環評通過，當地藻礁保育備受關注。對此，農委會副主委陳吉仲今（18）天表示，目前已經有委託中研院以及大專院校做調查，未來也會依據調查結果，與各界討論，盡力讓施工不影響到藻礁。
陳吉仲指出，如何保護藻礁需要專業對話，目前開發面積已經縮小為23公頃後，陸地上沒有碰觸到藻礁，海底部分，接收站的棧道有沒有影響到藻礁，可以透過中油、學術界的調查釐清；而離海平面超過6或10公尺深，就沒有行光合作用，對藻礁影響不大，這是學術界也有的共識。
對於環保署副署長詹順貴辭職，陳吉仲說，他是為了捍衛環評制度而遞辭呈，身為好友，必定會尊重這個決定。
陳吉仲提到，在施政時，所有政府體系都會交換意見，更會跟民間團體、學術界持續溝通，因此不希望有更大的體制內、外衝突，這樣才能降低社會成本的付出，讓政策由專業角度出發。
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