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農委會代理主委陳吉仲擔任災防中心總指揮，他說明，目前已成立七個跨部會的小組共同防疫，他表示，其中邊境管制組尤其重要，由於非洲豬瘟疫情尚未入台，由於病毒十分頑強，「國內不允許這樣的疫情傳入」。
農委會副主委黃金城表示，目前農委會已經超前部署，若是不幸真有疫情傳入國內，第一步希望能在場內就近掩埋，減少斃死體在外流動產生的傳染風險，而目前也已經尋得能處理160萬隻豬隻的掩埋場地，大多是台糖的土地。
但若是無法做到，就需要先電擊擊斃後再攪碎，密封後送往焚化場，與垃圾一同焚燒，環保署副署長張子敬表示，目前已經做好協調，斃死豬肉的燃燒分量僅佔5％，減少影響平常垃圾的燃燒量。
海洋委員會海巡署也表示，為了防疫非洲豬瘟，只要船舶偏離軌道或是也可疑行徑就會進行巡查，且航次有出入中國地區就會變成登點對象，廚房、冷凍櫃等都是盤查的重點範圍。
