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不過，在考量全民健康保險屬強制性的社會保險，民眾繳納健保費關係其個人就醫權益，且健保制度的設計，個人是以被保險人身分投保為原則，符合條件者始得例外以被保險人眷屬身分投保，健保費為專屬個人的基本生活支出，依納稅者權利保護法第4條有關基本生活費不得加以課稅規定，因此財政部廢止並發布新令明定以眷屬身分投保者，無論與被保險人是否為同一申報戶，其健保費均可由納稅義務人申報扣除。
財政部賦稅署舉例說明，甲君的健是以其配偶乙君（即被保險人）的眷屬身分投保，乙君辦理綜所稅結算申報時，並未列報甲君為配偶，甲君是由其子丙君列報為扶養親屬，雖甲君的健保係依附在乙君，但甲君健保費仍可由丙君於申報綜合所得稅時列舉扣除。
