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中科院已通知國防部MDM功能正常，非有害之APP，無須移除，可以正常使用。中科院已隨即進行更新版，目前初步測試正常。後續將透過國防部發布各軍種使用，也將對「Google Play應用程式驗證工具錯誤封鎖應用程式和發出警告」提出MDM非惡意程式聲明。
為了確保營區資訊安全，中科院在2016年推出「智慧型手機自動化管理系統」，限制手機藍牙、打卡、上網等功能，但是許多使用安卓（Android）系統的官兵抱怨無法安裝MDM，或是安裝後會閃退。不過，MDM因為無法攻破蘋果iPhone手機使用的iOS封閉式作業系統，官兵可以自行自手機中加以刪除，為了避免持有iPhone官兵自行刪除MDM，官兵使用iPhone出入營門時須由哨兵檢查，確認使用者是否已經手動上鎖，或是否擅自刪除程式。
