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伴侶盟談到，依據草案的設計，同性婚姻關係之一方並未與他方之血親成立姻親關係（草案中未準用民法親屬編有關姻親的規定），是與異性婚姻的重大差異，而我國法體制中諸多與利益迴避義務相關的一定親等內之姻親限制，以及與姻親相關的所有其他規定，在同性婚姻之情形，究應如何處理？希望能一步調整或釐清。
再者，草案允許同性婚姻關係當事人可以繼親收養他方「親生子女」，但不允許同性婚姻當事人共同收養，雖已回應許多已生育子女的同志家庭需求，但限制共同收養以及繼親收養僅限他方親生子女，保障未臻完足。
第三點，該草案第26條明定「宗教自由」保障，將來是否影響工作及教育等領域的反歧視條款之適用性？伴侶盟舉例，若一宗教團體設立教育機構、醫療機構，能否基於本條所稱宗教自由而拒絕僱用或解雇同婚者？須再請行政院釐清。
此外，跨國同性伴侶們也期待能來台登記結婚，但若一方持外國籍之同性伴侶本國法尚未允許同志結婚，則依我國《涉外民事法律適用法》第46條規定，屆時台灣公民與該外國同性伴侶恐仍無法在我國成立同性婚姻關係。該草案並未納入相關配套規定，伴侶盟呼籲，希望政府能衡酌修改《涉外民事法律適用法》或提出配套措施。
最後，該草案未準用但也未明文排除同性伴侶適用人工生殖法，草案說明此部份將交由其主管機關進一步研議，伴侶盟期盼主管機關衛福部後續應考慮相關配套。
伴侶盟談到，綜觀整體情勢，仍欣慰行政院並未向反同團體屈膝，也肯定執政團隊堅定守護司法院釋字第748號解釋的精神，確保同性別二人得準用民法婚姻相關規定結婚。也呼籲朝野立委於法案送入立法院後可以不分黨派，理性討論法案，以釋字748所稱婚姻自由之平等保護作為未來三讀通過法案的底線，還給同志該有的婚姻自由、平等的權利。
