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第二、須因購買自用住宅而向金融機構借款所支付的利息。也就是說貸款對象為金融機構，不包含私人間借貸，又貸款須以購置自用住宅為目的，若是「修繕貸款」或「消費性貸款」，則不得列報扣除，除非貸款確實是用於購置自用住宅並能提示相關證明文件者，仍可列報。另以房屋辦理擔保借款，雖係以購屋借款為名義，然若實際用途並非支付房屋款，仍不得列報。
第三、須為原始購屋借款，非屬購屋的增貸部分，所支付的利息不可列報。如貸款銀行變動或換約者，僅可就原始購屋貸款未償還額度內列報所付的利息，即新貸款超出原始貸款未償還額度部分仍屬增貸，不得列報，另應檢附轉貸的相關證明文件，如原始貸款餘額證明書及清償證明書等影本供核。
第四、每一申報戶以1屋為限，若是將所有2個門牌號碼的房屋打通供自用住宅使用，並以2間房屋向金融機構借款，且支付利息均符合上開規定，亦僅能選擇其中1屋之利息列報。
第五、購屋借款利息的扣除，以當年實際支付的該項利息支出減除儲蓄投資特別扣除額後的餘額，申報扣除，每年扣除額不得超過新台幣30萬元。
第六、須取具向金融機構辦理該房屋購屋借款的當年度利息單據（繳息清單）正本。如單據上未載明申報房屋的坐落地址、所有權人、房屋所有權取得日、借款人姓名或借款用途，應由納稅義務人自行補註及簽章，並提示建物權狀及戶籍資料影本。
不過，財政部中區國稅局也提醒，納稅義務人如果改向另1家金融機構貸款償還原購屋時所貸款項，在原來貸款還沒有還清的額度內所支付的利息，是可以核實減除，但要檢附轉貸的相關證明文件，如原始貸款餘額證明書、清償證明書或建物登記謄本及建物異動清單或建物索引等資料，以憑核認。
中區國稅局舉例說明，如王先生原來購屋時向A銀行貸款，還有300萬元本金沒有還清，今年改向B銀行貸款350萬元來還清A銀行貸款，那麼王先生雖然貸款350萬元，但只能就原先剩下的300萬元貸款部分繳付的利息列報扣除。
