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在實際管理上，美國食品藥品管理局採「負面表列」方式，僅規範列舉數10種藥物是不得使用在「經濟動物」，主因是擔心藥物殘留而影響公眾健康。至於非經濟動物如犬貓等伴侶動物，在藥品負面表列上則是完全空白，可見FDA尊重並相信獸醫師專業，完全信任獸醫師在治療伴侶動物時有著高度專業、藥品調劑及管理藥品的能力。
台灣藥政系統不同於美國，人用藥品由衛福部食藥署管理，獸醫師或動物用藥是歸農委會防檢局管理。此外，藥事法規定，須由醫師處方之藥品，非經醫師處方不得調劑供應，而醫師法條文中所稱之醫師並未包括獸醫師，且動物醫院也不是藥事法中所列的醫療機構，以致藥商無法將藥物販售給予動物醫院。
獸醫師團體強調，不管是納入動保法的規範或是修改藥事法，都願意配合。獸醫師具有專業資格，願意接受食藥署及防檢局共同管理相關人用藥品的使用。
針對「人用藥品使用於犬貓及非經濟動物之使用管理辦法」，全台灣獸醫師各公會及學會提出2大聲明：（一）願意接受人用藥品流向管制系統管理、（二）請藥師公會全聯會留給動物的健康一條生路。
對此，藥師公會指出，毛小孩之生命、健康及其醫療權益需要被保護，但我國建立已久且嚴謹之人用藥品管理制度亦不容破壞，藥師公會不反對「暫時開放」部分人用藥品予動物使用，但不應讓人用藥品淪為利益團體之生財工具。
