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不過根據了解，市府內部幕僚全都持強烈反對態度，因為柯文哲在上午在接受媒體訪問時，已經表明「準備時間不夠，沒辦法臨時生出100萬，今天不會去登記」，若是此時突襲式前往中選會領表登記，柯文哲長期經營的誠信與個人的政治形象將會破滅。面對國師團極力想要帶柯文哲去中選會登記，幕僚們也極力阻止。
而「幕僚團」與「國師團」，雙方就在市長室上演大鬥法。把柯爸柯媽都請上台北的「國師團」，不斷苦口婆心對柯文哲相勸，極力要求他在登記截止前到中選會領表登記，更讓黃文玲、張凱鈞，以及提供給柯文哲的「副總統人選」前台南市長參選人、伍彩集團創辦人兼總裁林義豐，先前往中選會準備領表等相關事項，而其他「國師團」成員，甚至一度想要用「硬架的」將柯文哲帶往中選會。而具「主場優勢」的「幕僚團」，直接守候在市長室門口，不讓柯文哲離開。
直到接近登記截止時間，「國師團」也直接將柯爸柯媽帶往中選會，試圖逼柯文哲就範。而「幕僚團」則持續守候在市長室門口，直到下午五點三十分，確定登記截止時間已過，才讓柯文哲前往中選會現場，並要求現場的柯爸柯媽與「國師團」們離開，最後柯文哲也驅車離開前往桃園參與活動。
市長室關鍵5小時堪稱政治宮廷劇，民間友人與柯粉組成的「國師團」，帶著基層柯粉的盼望，甚至將柯爸柯媽從新竹請到台北市政府，就為了苦勸柯文哲能夠領表登記參與總統連署；「幕僚團」則堅守立場，不願讓已經承諾「不領表登記」的柯文哲，在接下來的政治生涯，能夠有把柄落人口實，並維持柯文哲政治形象的完好。這場大鬥法雖然「幕僚團」暫時勝出，不過期間柯文哲猶豫不決的態度，恐怕會讓「國師團」與「幕僚團」間的紛爭，未來不時再度上演。
