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儘管如此，對於疫情的迅速擴散與造成的傷害，鍾南山仍認為，武漢市政府未能在初期就控制疫情，明顯失職，並聲稱：「我們不明白為何病毒傳染力這麼強，這是很棘手的問題。」
現年 83 歲的鍾南山在 2003 年 SARS 期間，對於中國大陸的防疫工作有非常重要的貢獻。對於上週過世的「吹哨者」李文亮醫師，鍾南山頗感惋惜，甚至在受訪時情緒激動的表示：「在大多數中國人的心目中，包含我在內，他（李文亮）是英雄，我也非常以他為傲。他在去年 12 月底就試圖告訴大家真相，但卻不幸過世」。
鍾南山並聲稱，除了李文亮醫生以外，中國還有其他數百名醫師渴望說出真相，而他們的聲音也需要被聽見。至於後續處理，他認為中國政府應盡快從嚴立法，禁止野生動物交易和食用，並協助建立起全球傳染病的預警系統、改善疾控中心的相關運作模式。
