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而陳時中踏入公職的關鍵，要從他和前總統陳水扁的淵源開始說起。1994年他當選台北市牙醫師公會理事長後，開始投身公共事務，推廣牙科新觀念，並多次與時任台北市長的陳水扁同台出席相關活動；隔年成為牙醫師公會全國聯合會理事長，打破常規，率先推動健保總額支付制度。
2000年，陳水扁投入總統大選，時任牙醫師公會顧問的陳時中，號召200名牙醫師一同加入民進黨挺扁，從此開始涉足政治圈。2004年，陳水扁爭取連任，陳時中則被民進黨提名不分區立委，名列第26。
2005年，陳時中獲陳水扁重用，成為第一位為牙醫背景的衛生署副署長，而他歷經三位內閣改組，仍坐穩副署長位子，不過在此之前，他就已擔任過衛生署全民健康保險費用協定委員會委員、全民健康保險監理委員會委員，對公職經歷並不陌生。
2008年政黨輪替，國民黨執政，民進黨籍的陳時中卸下公職，重回牙科診所執業，同時擔任台北醫學大學董事；2012年，時任民進黨主席的蔡英文競選總統，陳時中擔任醫界後援總會總幹事，並為蔡英文醫療長照政策白皮書執筆人、民進黨智庫醫療政策小組召集人。
2016年，蔡英文在總統大選中勝出，陳時中出任總統府國策顧問；2017年，林全內閣改組，陳時中接下衛福部長一職，卻也是外界質疑的開始，牙醫師的地位引起輿論，接踵而來的挑戰，反讓陳時中越挫越勇。
2020年，因應新冠肺炎疫情，衛福部任務編組中央流行疫情指揮中心，陳時中擔任指揮官，自成立以來防疫記者會幾乎無間斷，以淺白語言與透明訊息原則「防疫誠實中」，讓國人像吃了顆定心丸，滿意度扶搖直上，也因此成為近期最紅的政治明星。
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