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但無法用於電子票證加值、超商及郵局代售車票付款、車站（車上）補票、鐵公路聯運票、行李暫存及包裹業務、 Joint-Pass 票券、自動售票機儲值卡、貨運業務、專列及客廳車等租用車廂、車上銷售便當、商品及飲食類等服務。
根據規定，紙本三倍券的使用限制為「不得找零、轉售、兌換或退換現金」，因此若使用紙本三倍券購買台鐵車票皆「不得退票」，即使是部分使用紙本三倍券、部分使用現金購買，也無法退票，但可換票，且不限制次數，第 1 次換票免收手續費，第 2 次以上換票需收取手續費（現金支付），依台鐵現行規定辦理。
至於綁定數位三倍券的電子票證部分，台鐵說明，因其回饋機制是由電子票證公司轉請經濟部認定。信用卡及行動支付購票、退票無論是否綁定數位三倍券，均比照現行規定辦理，其回饋機制係由發卡銀行及行動支付業者轉請經濟部認定。
此外，台鐵 7 月 15 日至 8 月 15 日推出車站商場消費優惠，民眾持台鐵車票至微風台北車站、環球 Global Mall 板橋、南港及新左營車站、 CITYLINK 松山及南港車站與台北凱達大飯店，可享 85 折起優惠。
