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這個研究是透過在各潮間帶，各設二條垂直於海岸的測線，分別位在遊客密集區（導覽區）的內、外，每條測線以0m為起點（高潮線），每5公尺設置一個1平方公尺的樣框，在這區域內使用目視徒手採集、挖掘、拍攝等方式進行調查，再和五年前的相關資料相比。
張水鍇教授多年來致力於環境生態等相關研究，經過長期的觀察，他們發現遊客步行、踩踏的導覽區，生物種類和個體數量也比區外減少30％，充分理由顯示，人為的影響還是生態環境最大的衝擊原因，而這次的離島爆炸般的湧入人群，可想而知遊客踩踏破壞的狀況，更是重挫當地生態。
怎麼尋求解方，張水鍇提出三大方向，首先針對潮間帶要做分區管理，保留物種繁衍，也規劃做生態觀賞走廊，讓其他地方不會被遊客嚴重踩踏， 將來還建議地方政府要推動繁殖期禁止夜間導覽，希望在3到6月的繁殖期，禁止遊客夜間導覽以及使用紅光燈，最快會在明年開始施行。
不過，他也坦言，好不容易開始起步維護生態、物種，又看到新聞上點出離島遊客爆量，心情上確實有點洩氣，但他也明白被疫情打擊的經濟，需要復甦的管道，只希望這些配套措施，應該隨著國旅興盛，同步被政府重視，他投身蘭嶼的研究，希望不要步上小琉球過度商業化的後塵，及早做好物種保護的規劃。
琉球鄉公所清潔隊隊長黃朝舜就透露，一般平常每日垃圾量大約7噸，現在因為暑假、推國旅，每天垃圾增量到至少8到10噸，甚至先前在端午連假四天，每日垃圾量更倍增到至少15噸，以每年發包廠商，平均清運垃圾量上限2400到2800噸估算，這樣下去小琉球恐成垃圾島。
綠島跟蘭嶼也同樣面臨垃圾增量問題，因為大量的遊客，讓每日垃圾量增加到大約兩公噸，將從離島運回本島焚燒，加上台東縣其他地區，每日至少生成90噸的垃圾要處理，但目前多半是外運到代燒縣市（高雄），但平均一週只能代燒140噸，多餘的垃圾只能暫放掩埋場，雖然地方政府也說，焚化廠有修繕計畫，但這遊客湧入又快又多，只一昧推國旅，沒有配套，雖然振興了經濟，但這環境傷害，恐怕久久不能平衡。
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