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根據《NHK》，為減緩疫情擴散，西村康稔考慮要求地方配合防疫措施，縮短店家營業時間從晚間10點提早至8點結束營業，東京都方面則是必須強化減少人潮的措施。政府內部人士指，中央對於地方的防疫政策有所不滿，批評「（東京）都什麼都不做，就算宣布緊急狀態，情況也不會改變。」
日本媒體形容首相與知事間的防疫存在「溫度差」，首相菅義偉12月20日的全國民調支持度僅39%，近8成（79%）的受訪者認為，政府太晚停止振興國內觀光業的「Go To Travel」方案；7成的民眾認為菅義偉在防疫上未展現應有的領導力。若是中央答應東京都知事等人的緊急狀態請求，等於間接承認中央防疫政策失敗，對菅義偉來說又是一次打擊。
但防疫問題迫在眉睫，宣布緊急狀態仍須修法確保防疫政策落實，日本國會已預定在1月18日召開會議，推動特別措施法修法，增修罰則針對不配合縮短營業時間、暫停營業等防疫措施的店家，期望在1月底完成修法。
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