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市議員許淑華也質疑，北市府在疫情期間，透過台北通app介接1922實聯制系統，累計了超過5000萬筆民眾個資，而這些資料未來會不會有可能為北市府大數據中心所用？甚至有可能用販售的方式，讓私人企業或機構也能使用這些民眾個資？
對此資訊局方面解釋，1922實聯制系統所取得的資訊，按照中央法規僅能留存28天，28天後將會全數刪除，不會留存於大數據中心。此外資訊局也嚴正表示，實聯制系統所累積的相關資料，也僅會用於疫情調查，並不會用於其他用途。
台北市政府發言人陳智菡則表示，台北通app就像一個入口、一個快速通道，通過之後大部分資訊不會留在台北通，例如：防疫實聯制掃完，資訊會存在雲端28天，只有防疫需要才會由衛生單位調閱，過期了就自動銷毀；其他福利身分（例如65歲以上長者、學生、低收入戶等的個資）原本就存在各業務單位（敬老卡資料在社會局、借書證原本就在圖書館），根本不在台北通。
陳智菡也強調，台北市為了保護個資還設立了臺北市政府資料治理委員會設置要點、成立資料治理委員會，台北市是要用大數據輔助市政，這是進步e化的世界趨勢，市府要應用大數據也得經過委員會的討論、有會議要點，「一定有會議記錄、把資訊都去識別化才可以使用。」
