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第一期的Com-Cov1研究發現，比起兩劑都是同廠牌的疫苗，混打的方式會引起較強的全身性不良反應，例如頭痛、發燒、關節與肌肉疼痛等，其中發燒的不良反應程度由大到小分別是：BNT／AZ > AZ／BNT > BNT兩劑 > AZ兩劑。
研究也發現這些不良反應越強的受試者，使用止痛退燒藥（乙醯胺酚，Paracetamol）也增加。此研究在50歲以上者觀察到混打疫苗使不良反應增強，作者認為年輕族群混打疫苗的不良反應有可能會更大，需要更多研究。
而第二期的Com-Cov2研究發現，間隔28天施打疫苗的463名受試者，混打第一劑AZ加第二劑BNT疫苗後，產生針對新冠病毒的免疫球蛋白濃度，比施打兩劑AZ疫苗者高，但無法證明第一劑BNT混打第二劑AZ的效果不輸給兩劑相同廠牌的疫苗，兩劑之中任何一劑施打BNT疫苗者的細胞免疫反應則與施打兩劑AZ者大致相同，而此實驗結果可提供接種第一劑疫苗後過敏或產生嚴重不良反應者選擇其他疫苗接種時的參考。
