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日本籍的種村碧君，原名「李碧君」、「李淑雅」，曾為杏林新生製藥公司負責人，也是吳淑珍友人。特偵組（已解散）當年偵辦國務機要費案時，她為掩飾吳淑珍犯行，涉犯偽證罪，事後因自白獲緩起訴。
由於2009年北院審理國務機要費案時，發現檢方沒處理此部分，經法院告發，2015年8月，檢方指控，種村碧君自2003年3月至2005年7月間，提供135張自己或友人消費的發票給吳淑珍核銷扁的國務機要費，共542萬9220元，依涉犯貪汙罪起訴。
法院審理時，種村碧君辯稱，她是看別人給吳淑珍發票就跟著給，吳淑珍沒有跟她要發票，她也不知道吳淑珍要發票做什麼，她認為是要兌獎。
2017年北院依貪汙罪判處4年，褫奪公權2年，2020年高院駁回上訴，維持相同刑度，2021年2月最高法院認為，二審判決理由不完備，調查未詳盡，將有罪判決撤銷發回更審。
2021年12月更一審言詞辯論時，種村碧村律師辯護稱，國人直到2006年6月22日新聞披露才知道有「國務機要費」這名目，種村碧君當然也無法想像總統夫妻會詐領公款，她事前也不知總統有國務機要費。
