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隨著確診案例數增加,醫療系統壓力倍增,急診室人滿為患,有香港醫護人員形容,「床貼床、握到手,周圍都是人」、「我們在幫病患做心肺復甦術,可能就有遺體伴著你」。而急診室當中又有確診患者,感染難以控制。但是醫院的病房也一床難求,患者也只能待在急診室中,在等候病床期間離世的病人更是難以計數。
不僅病床爆滿,由於死亡人數暴增,醫院停屍間也都「客滿」,甚至出現了「屍疊屍」的情況。殯儀館則是將貨櫃改裝成臨時冷凍貨櫃,做為「臨時停屍間」,火葬場增加火化時段來加速醫院屍體移走的速度。

另外因為養老院爆發感染,卻因為醫院沒有足夠床位,導致長者必須返回養老院,讓院內疫情持續爆發,最後更多長者得前往急診室求診,造成惡性循環。
不過外界認為,港府的清零政策也是造成疫情一發不可收拾的原因。港府至今持續採取圍封措施,目的是「動態清零」,即早發現、早切斷病毒。但在疫情大爆發之後,港府似乎顯得手足無措,香港官員在中央指示下繼續「動態清零」,但又知曉西方國家的「與病毒共存」路線是可行方案。因此在香港疫情越趨嚴重,部分防疫規定反而放寬。
香港政府在疫情政策上出爾反爾,一下稱不實施全民檢測,過沒幾天又宣布將在3月進行全民檢測;2月8日香港特首林鄭月娥表示特首選舉不會延期,10天後又表示特首選舉延期。港府朝令夕改令,更讓民眾無所適從。