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彭文正質疑北院分案不公，提行政訴訟要求重新分案。張詠惠於2021年10月18日裁定論文案暫停審理，直到重新分案訴訟終結。
北高行認為，彭文正的分案請求被立法者規畫於民事司法範疇，應依《民事訴訟法》聲請法官「迴避」，2021年10月29日駁回聲請，彭提抗告，最高行政法院今年2月24日裁定抗告駁回確定。張詠惠於3月24日裁定恢復「確認蔡英文博士論文不存在」審理，但尚未安排開庭時間。
由於彭文正緊咬「論文門」衍生不少訴訟，包括蔡英文對他提告妨害名譽，但彭人在美國沒出庭，遭北院發布通緝；彭也對張詠惠法官提告求償200萬元，去年底北院判彭敗訴；彭另自訴控告蔡英文委任律師連元龍、三立新聞網涉妨害名譽，去年底北院判他敗訴；彭自訴控告總統府發言人張惇涵涉妨害名譽，北院審理中。
