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有電子媒體報導，駐紮在澎湖的空軍天駒部隊也在同日上午派出經國號戰機升空警戒，並在機翼掛上天劍一型短程空對空飛彈、機腹掛上天劍二型中程飛彈。不過，國防部否認外島提升戒備，一切都是例行演練。
每年4到9月，天候狀況有利戰機執行任務，共機經常利用這段時間在海峽中線以西密集從事飛行訓練。為了縮短預警時間，保護台海空防安全，空軍天駒部隊1964年開始進駐澎湖，要求接獲升空命令後5分鐘內就必須起飛，天駒部隊戰機進駐澎湖馬公機場後，民用機場就變身軍民共用機場，軍機與民航機都必須協調跑道使用順序，以配合戰備任務。
天駒部隊早年操作F-5E老虎二式(Tiger II)戰機，在經國號戰機成軍後，改由經國號戰機接手天駒空防任務。每年4到9月，空軍都會派遣一個中隊的經國號戰機到澎湖執行「天駒任務」。澎湖「天駒任務」由台南一聯隊及台中三聯隊經國號戰機輪流進駐，每個聯隊分別執行3個月任務。
