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這起萬人血清檢測曝光後，由於部分參與者未得知研究目的，引起外界質疑，指揮中心也曾揚言要政風調查。陳時中說，就目前調查來看，該研究有部分瑕疵，但也不到違法或脫序行為；至於該研究的監管或指示的做法是否合規合矩，會再做進一步調查。
外傳指揮中心已事先看過該研究的成果？陳時中說，確實有收到一些簡單的數字，但他在這裡不便公布，應該要讓研究者自己出來說明，讓社會爭議就到此為止。
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