有關行政院召開記者會宣布，各縣市所提自治條例萊劑零檢出各自為政，亂成一團，因違反憲法並牴觸中央法規，中央將就舊有已訂的自治條例直接函告無效，新訂自治條例的縣市不予核定一事﹔澎湖縣政府表示，根據釋字第738號解釋意旨，地方政府本可以因地制宜，執行比中央政府更嚴的措施，為人民把關，希望中央能尊重地方自治的精神，不要悖逆民意。
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副議長陳雙全強調，中央不做，地方做！中央不管，地方管！中央不護民，地方護！為了全民的健康與下一代的未來，基於人民食安風險零容忍，在中央具體核定之前，地方政府也應先依照自治條例精神進行。
澎湖縣政府表示，地方主管機關本來就有履行食品安全衛生管理法第 5 條所規範的「必要管制措施」職責，要求瘦肉精0檢出並加以查緝，依法有據，理所應當。縣府希望中央尊重地方民意，讓各縣市較嚴格的食安條例順利生效。
