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不過由於縣市長選舉遺留下多個選區立委必須進行補選，二次的立委補選，蔡英文執政三年失民心的效應仍持續發酵，讓二次立委補選雖然平安通關，但票數卻大幅減少，尤其台南第二選區立委補選，郭國文的得票數更只有小幅多於依靠韓國瑜的謝龍介。
對賴清德而言，台南市是他苦心經營多年的根據地，在他離開台南市長職位前，賴清德更獲超過七成的支持率，但在蔡英文執政後，不但這個民主大本營的票源大失，市長選舉黃偉哲也只是險勝，蔡英文執政的不利效益，讓請辭獲准的賴清德大感意外。
此次賴清德返鄉為郭國文輔選，選情出乎他意料的艱困，雖然有退黨參選的陳筱諭作梗，不過國民黨派出的謝龍介，一心走高雄市長韓國瑜路線，只來二次輔選的韓國瑜效應，竟然讓郭國文招架不住，也讓賴清德在這次輔選中，真切的感受到民進黨總統可能要換人做。
賴清德在首場新書發表會中曾表示，他是因為台南立委補選後，才決定投入總統初選行列，這個決定不是早已預謀的，而是因為台南立委選情，讓他感受到民進黨的危機已到了「只剩一口氣」的嚴峻地步。
雖然賴清德口口聲聲說「寧可輸掉初選，也不願意傷害蔡英文」，不過，選舉是最現實的，蔡英文雖然在老天送來大陸習近平「九二共識、一國兩制」等「習五點」的蠻橫說詞及做法下強勢回應，重新獲得台灣民眾的支持，讓她士氣大增，不過要在初選民調前追回失去已久的民心，確實是件困難的任務。
尤其綠營連續公布的幾個民調，不論是挺蔡或是挺賴，都顯示蔡英文若在此事與賴清德民調決勝負，勢必只有退出選舉的選項，這也是民進黨保皇派要組成五人協調小組，進行蔡賴協調的主要因素。
對民進黨而言，蔡賴配是民進黨目前的最佳選項，而重新調整過的黨中央也多以輔選蔡英文連任做準備，目前民進勝出的賴清德在見過五人小組後，是否會退出自己口中「君子之爭」的初選戰，與蔡英文搭配，只有看賴清德的政治睿智如何決定。
