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柯文哲表示，「對一個卸任總統不需要這樣處理，也不要說虐待，對待方式不是很好」，陳水扁會有嚴重的身心症，跟龜山監獄惡劣的環境有關。後來雖然轉到別的監獄去，但那時他已是包尿布、尿失禁，手發抖、拿拐杖，狀況已經不是很好。
柯文哲說，2014年他贏得選舉後，就交代文化局要替陳水扁做口述歷史，「我個人理念，發生在台灣島上的一些事情，不管是怎樣，終究是歷史一部分，應當要保存下來」，只是當時仍是馬英九執政時期，雖然同意陳水扁保外就醫，但陳水扁仍有顧忌，不太願意接受訪問。
台北市長柯文哲5日出席前總統陳水扁口述歷史新書發表現會，提及陳水扁在龜山監獄受柯文哲數度哽咽，無法言語。 （圖／記者林柏年攝，2019,05,05）直到2016年，柯文哲指出，總統蔡英文贏得選舉，陳水扁才願意接受訪談，不過因為是因為文官體制的關係，加上又適逢2018年選舉，因此才延後發表這本口述歷史的書。而前陣子他到高雄拜訪陳水扁時，也向陳水扁表示，「台灣每次選後就是下次選前」，沒有什麼適當的時機，該做就做。
柯文哲說，台灣社會若能用開放心態來看待發生在台灣的一切，整個台灣社會就會比較好，因為「發生在台灣島上一切，都是台灣歷史一部分」。他強調，「堅持—陳水扁口述歷史回憶錄」是以陳水扁個人角度看這段歷史，但每個人看歷史都會有不同想法。
他表示，史料判讀只是記錄這段歷史，讓台灣人有更多認識及更多了解，或許這樣才能讓台灣意識形態抗爭可以愈來愈少，而他還是希望整個台灣可以和平的往前進。
台北市長柯文哲5日出席前總統陳水扁口述歷史新書發表會，兩人互動引發外界關注。（圖／記者林柏年攝，2019,05,05）