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此外局處首長部分，其中遭到最猛烈批評的，則是都發局長黃景茂及警察局長陳嘉昌。因為大巨蛋案遭外界質疑有「護航遠雄」疑慮，且未積極處理大巨蛋各項違規的黃景茂，在互評中也遭抨擊「能力、擔當沒一樣及格」，甚至遭匿名要求柯文哲換掉此人；而陳嘉昌則被形容成「畏首畏尾、唯唯諾諾」，對上司和下屬態度不一、已經是「待退心態」。
根據了解，首長互評制度向來應當只有遭到評論的首長自己知情，而這次評論意見居然全數公開，從戶屏制度上路至今還是頭一遭，且用詞主觀和直接，也讓不少被點名的首長感到委屈、不滿。還有人認為，這恐怕是研考會的行政作業有疏失，才會不小心讓意見「全都露」。
對此台北市政府發言人陳智菡表示，首長都可以看到其他首長的好評、負評，這是秉持公開透明精神，有競爭才有進步、首長互評是屬開放意見。「過去議員也認為，如果有負評應公開，這是鼓勵大家有競爭才有進步。」陳智菡說，「首長互評行之有年，主要是讓首長們知道有哪些須精進，將檢討報告當作鼓勵和優化的力量」。
