教育部前部長潘文忠因台大校長遴選一事辭職，行政院宣布由中研院院士吳茂昆接任，教育部今（19）日舉辦部長交接典禮，由行政院政務委員林萬億監交，並由代理部長姚立德交接給吳茂昆，但潘文忠並未出席交接典禮。
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先前台大校長當選人管中閔被發現涉及資訊揭露、利益迴避、學術倫理等疑慮，並被踢爆曾長期赴大陸兼職，違法教育人員任用條例等，並因涉及政務官任職或管制期間偷跑，遭檢調依國家機密保護法調查，教育部也組織跨部會諮詢小組釐清，至今仍未核准管中閔的台大校長資格。
不過許多人認為，這是藍綠惡鬥的結果，藍營人士更批評潘文忠是政治打手，因為先前爆出內政部長葉俊榮也曾赴陸兼職，準教育部長吳茂昆也被爆出擔任中方的長期顧問，卡管一案根本是雙重標準。
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面對外界龐大的壓力，潘文忠最後提出書面辭呈，行政院最後宣布由吳茂昆接任教育部長一職，今天由林萬億監交，代理部長姚立德交接給吳茂昆。
雖然潘文忠沒有出現，但林萬億致詞時仍說，他要對潘文忠致最高的敬意，也希望潘文忠繼續給教育部意見參考。