國防部長嚴德發日前在立法院接受立委質詢時說，國軍不會為台獨而戰，總統府祕書長陳菊 17 日被問及此事時表示，她尊重個人的政治主張，但國防部長必須捍衛台灣安全。
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此外，據傳中國大陸正在蒐集「台獨名單」，陳菊也對此做出答覆，他說，台灣民主的發展有很多歷史因素，面對很多複雜的歷史因素，大家要有更多寬容，對於不同政治立場的人，現階段，她期待有更多對話、和解、理解、尊重彼此立場，這份「台獨名單」，她還不了解。
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陳菊指出，總統蔡英文對兩岸的立場非常清楚，她必須捍衛台灣主權、保護台灣主權，總統對兩岸的立場，她就職時就說得很清楚，就是根據中華民國憲法、兩岸人民關係條例，她不做任何挑釁，立場也至今未變。