國軍開放官兵使用智慧型手機在營區內特定地點使用，但是必須安裝中科院研發的「智慧型手機自動化管理系統」（ MDM ），限制智慧型手機拍照、打卡、熱點分享與藍牙傳輸等功能使用。不過，這套程式卻被Google認定為惡意程式，中科院今（20）日澄清表示，MDM非惡意程式，更新後可正常使用確保資安。
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中科院表示，MDM可以透過Internet下載安裝App，研判可能因下載安裝行為數量較多，經Google大數據分析，判讀為可疑之APP，但並非有害軟體。
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中科院已通知國防部MDM功能正常，非有害之APP，無須移除，可以正常使用。中科院已隨即進行更新版，目前初步測試正常。後續將透過國防部發布各軍種使用，也將對「Google Play應用程式驗證工具錯誤封鎖應用程式和發出警告」提出MDM非惡意程式聲明。
為了確保營區資訊安全，中科院在2016年推出「智慧型手機自動化管理系統」，限制手機藍牙、打卡、上網等功能，但是許多使用安卓（Android）系統的官兵抱怨無法安裝MDM，或是安裝後會閃退。不過，MDM因為無法攻破蘋果iPhone手機使用的iOS封閉式作業系統，官兵可以自行自手機中加以刪除，為了避免持有iPhone官兵自行刪除MDM，官兵使用iPhone出入營門時須由哨兵檢查，確認使用者是否已經手動上鎖，或是否擅自刪除程式。