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國安會秘書長吳釗燮與外交部長林佳龍屢傳不合，連吳釗燮妻子都發聲表示「眾口爍金可怕」，並強調吳不是一個「歹鬥陣」的人。外交部長林佳龍今回應傳聞強調，兩人熟識，長期合作都有默契，是「好鬥陣」的朋友。
《鏡週刊》日前報導，林佳龍上任外交部長後任用的人事，與吳釗燮卸任後推薦的有所不符，因此種下嫌隙；此外，國安會會議會把林擋在門外，而外交部送去給國安會的電報也開始刻意篩選等。
國家安全會議12日澄清，這項報導內容多為杜撰不實，亦無妥為查證，事實上國安會及外交部溝通合作緊密，類似報導對所有正為國家相關工作努力的團隊極不公平，更損傷國家利益，令人遺憾。
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林佳龍今（14）日出席文總音樂節活動後受訪表示，外界有些錯誤報導，或是比較誇大不實的新聞處理，外交部跟國安會都有發新聞稿了說明。「我跟國安會秘書長吳釗燮熟識，長期合作有默契」，希望大家支持外交部跟國安會團隊，不要擴散不實報導，以免影響外交部士氣跟國家形象。
林佳龍強調，吳釗燮是「好鬥陣」的朋友，兩人一週開會多，聯繫密切、合作愉快，重大事務上會並肩作戰。