馬英九基金會人事風波再起，遭指控涉入財政紀律的前執行長、國民黨副主席蕭旭岑接受專訪時直言，此事確實傷害兩岸關係，否則為何基金會把兩岸交流全部停止。基金會稍早發出聲明，稱對於媒體報導因財政紀律案，兩岸交流工作會中斷，與事實不符。
蕭旭岑今接受資深媒體人王淺秋《千秋萬事》專訪時也向「大九學堂」第九期學生表達歉意，參加完活動就沒有後續活動，本來要訪陸或在台灣辦的活動都取消了，很多學生希望讓台灣更好，支持兩岸關係。
馬英九基金會則回應，馬英九董事長認為非常兩岸交流非常重要，在九二共識的基礎上，馬英九基金會這幾年多次推動兩岸青年交流與互訪，已建立穩定的基礎。
基金會聲明稱，戴遐齡「執行長」表示，本會待財政紀律案結束後，兩岸交流就會繼續進行。