日本、菲律賓28日發表聯合聲明，同意正式啟動兩國專屬經濟區（EEZ）及大陸棚海洋邊界劃定談判，範圍在台灣東部，引外界隨即質疑是否會台灣海域權益？外交部重申，我國領土主權與海洋權益不容質疑，會要求日、菲不得排除或損及台灣權益，應與台灣協商。而海委會副主委張忠龍今（3）日也表示，海委會將依台日、台菲既有漁業協定與相關法令辦理，不會讓我國權益受影響。
張忠龍今受訪指出，外交部已經講了政府立場，也就是日、菲談判應考量我國經濟海域權益，而台灣和日、菲有分別簽訂漁業協定和漁業執法協定，海委會會按照相關法令規定來做相關動作，不會影響我國權益。
至於針對外界質疑我方立場不夠強硬，張忠龍表示，談判的部分是外交部的權責，目前海委會在所有海域部分，已根據漁汛期的情形，在西北、東北、台日、台菲等海域，派遣大艦執行護漁勤務。