南部地區水情狀況也不佳，曾文水庫蓄水率已降至34.4%、高屏堰河川流量已降至每秒16.7立方公尺，不僅嘉義、台南地區水情燈號為稍緊的綠燈，高雄地區也開始實施第一階段限水。經濟部水利署今（21）日表示，南區水資源局把握時機清淤，降低未來缺水風險。
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南部地區未降雨日數持續增加，截至3月20日上午7點，曾文水庫蓄水率已降至34.4%、高屏堰河川流量已降至每秒16.7立方公尺，水情更形嚴峻，目前嘉義及台南地區水情燈號為稍緊的綠燈，高雄地區也自20日起實施第一階段限水措施。
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水利署表示，今年正值水庫水位低落，更是加強清淤的好時機，南水局除了積極積極總量管控、區域調度之外，更把握時機清淤及推動曾文排淤隧道工程，期使水庫功能永續，原預計清淤總量58萬立方公尺，提升2倍以上數量至121萬立方公尺，至今實際清淤量52.76萬立方公尺，預計5月底前可達目標清淤量。
此外，南水局也積極籌辦曾文水庫防淤隧道工程，於102年3月開工，目前超前施工進度達到89.17%，預訂於106年10月底完工，完工後預估水力排砂效益年平均104萬立方公尺，期以多元清淤方式減緩水庫的淤積。