九合一選舉落幕，公投案第16案否決了2025非核家園的時間點，針對公投結果，經濟部一直都沒有公開回應，經濟部次長曾文生今（27）日遭媒體堵訪才首度回應強調，行政團隊尊重公投的結果，就法律程序來說，會等整合釐清掌握問題後，才會去跟國會報告與討論，並配合行政院的指示來做。
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今年的九合一大選綁公投，其中有3項能源議題過關，包括第16案廢除電業法非核家園條款，否決了電業法第95條第1項2025非核家園的時間點；第8案反深澳公投，要求停建深澳電廠，並不得新增燃煤發電機組；第7案反空汙公投，要求降低火力發電量平均每年至少1%。
曾文生今日出席「GLCT第六屆年會暨商貿運籌升級轉型研討會」接受媒體訪問時回應，就法律程序上來講，電業法95-1項會依照相關程序配合行政院來處理，後續會推動相關作業，「院長昨天回答相當清楚，公投結果一定尊重，但具體執行情形要研議，會提出後續作法與國會討論，經濟部會依照院長的指示來工作。」
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至於外界說法「公投結果明確反應民意，政府卻還是宣示非核家園時程表不變，質疑公投投假的」，他則再次強調，行政團隊尊重公投的結果，但是後續的改變很多需要研議，像是火力發電每年減少1%要如何去達成，深澳電廠廢止燃煤發電，現在本來也就沒有燃煤機組的規劃，將依照行政院指示方向來執行。
此外，針對核一廠1號機的除役工作卡關，運轉效期即將在12月5日屆滿，除役環評卻還沒過，曾文生表示，電廠延役都有規定，環評進度卡關多少會影響進度，但流程還是會繼續走，核二也超過申請延役的期限，只有核三有機會，想要延役就要在明年7月前提出申請，才能符合電廠使用執照到期前5年申請的規則。