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中國國民黨立委林德福質詢時質疑，以陳水扁的健康條件可以保外就醫，但卻有其他受刑人重病、受到拖延，在保外就醫後7天內就死亡，難道受刑人生命價值有所不同？
對於林德福的質疑，邱太三表示，此現象凸顯監所醫療設備與人員嚴重不足的情形，因此在准許、駁回保外就醫兩者間就相當為難。他說，目前矯正署正針對保外就醫標準不完善處著手研議，包括審核過程、保外就醫機制都有在檢討。
邱太三在報告時指出，現行保外就醫制度，只要受刑人罹患致死率高疾病，且預料短期內將會死亡，或是身心障礙嚴重、無法自理生活者，監獄都可以報矯正署核准保外就醫。他也表示，近年來保外就醫案件已逐年提升。
至於民眾跟拍陳水扁一事，邱太三則認為，由於陳水扁仍然是位病人，因此對其拍攝影片可能會造成心理層面的影響，坦白說是有些殘忍。不過他也說，拍攝影片是一個階段、上傳至網路又是另一個階段，這是兩個不同的行為，但後者他個人認為嚴重不當。
