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民主進步黨立委蘇巧慧質詢時表示，國教署每年約有新台幣1000億元的預算，但在實驗教育的部分只有1.7億元，僅占0.17%，且現有法條只提到地方主管機關可獎勵評鑑優良者，但並沒有給實驗教育對象相關補助，建議應給予相關機構和學生更多資源。
教育部國教署長邱乾國說，教育部已將相關補助辦法規劃在子法中，未來的補助項目、範圍跟數額，都會明確化。
民進黨立委張廖萬堅、吳思瑤提議，現有的實驗教育應延伸到大學。
潘文忠表示，將實驗教育延伸到大學是必然的方向，教育部正朝這個方面努力。
高教司長李彥儀說，因應未來參與實驗教育的學生人數將會增加，教育部將會逐年提高大學特殊選才的招生名額，讓更多學生能適性發展。
此外，民進黨立委陳亭妃說，修法將實驗學校數提高至最多可占各縣市學校數的1/3，憂心縣市政府會紛紛衝量，反而影響教學品質。
潘文忠說，相關修正草案有規定，只要縣市的實驗學校超過5%，就必須向教育部申報，由教育部逐案審查，絕對會確保實驗學校的品質。1061109
