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農業部表示，進口雞蛋調度給洗選業者洗選包裝分級後，供應超市、超商、量販店等通路以牌價販售，提供消費者平價蛋選購，確保各消費通路雞蛋供應無虞。進口雞蛋價差不是補助給特定進口商，而是吸收進口蛋到岸價格差額、關稅等差價，全民為最大得利者。
針對政府吸收價差的經費來源，農業部表示，經費編列是根據農業發展基金收支保管及運用辦法第5條第1項第4款，本基金用途包含「辦理農業產銷調節所需之支出」。今年因為國內雞蛋生產不足，面臨產銷調節問題，因此站在糧食安全的角度，需要進口雞蛋才能滿足國內民眾需求；站在農業發展立場，進口雞蛋可以緩解國內雞蛋需求，讓國內雞蛋產業有時間喘息、調整、淘汰老母雞，以健全產業發展，因此用農發基金來支應進口雞蛋的價差吸收一切合法。
農業部強調，農業部並非只有實施雞蛋專案進口，針對雞蛋產業韌性提升，過去就有提供蛋雞農禽舍改建的政策性農貸，以低利貸款方式協助雞農改建禽舍，111年到114年更投入約44億元補助禽舍改建升級、智慧省工設施設備、建置冷藏（凍）庫與冷藏（凍）車廂等冷鏈設施設備，污染防治淨零循環永續等轉型相關計畫。
