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邱國正表示，中共海空軍不分時段在我東南與西南造成紛擾，海空軍與飛彈部隊都在戒備，現在台灣周邊局勢真的很嚴峻，以前提升戰備通常是偶發狀況來後提升，3到5天就可擺平，現在同仁每天都在洞（衡指所、空軍作戰指揮部）裡面，包含他與參謀總長都經常在洞裡面穿梭。
針對國民黨質疑中科院部分，邱國正表示，軍購面臨許多外交處境現實性，不確定性太多，他要求與期望國防自主能力越來越高、國防工業能進步、科技人才能提升，依據中科院既有基礎強化。
針對立委質疑預算內容，邱國正強調，最後預算國防部一定會分類，各項、各元件會依據每年評估經過預算中心審查，從來沒有把委員擱到一邊的想法，「早年長官說不要把兵當傻瓜，幾十年前長官就這樣提醒，現在當部長更不會有傻瓜軍官、傻瓜委員、傻瓜平民，我們都嚴正以待」，絕對不會違法，會遵守財政紀律。
朝野協商歷經2個多小時，對於是否制訂特別條例、海空戰力提升計畫採購項目、計畫採購所列項目是否得採限制性招標等關鍵條文一直無法達成共識，游錫堃最後裁示，爭議條文保留到明日院會表決處理。
