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不過國稅局指出， Uber 荷蘭母公司 Uber B.V. 已完成在台稅籍登記業務，且登記的名目為叫車服務收入登記稅籍，未來將繳納 5% 營業稅，國稅局認為應該是 Uber 打定主意在台長期營運。
但台北國稅局強調，雖然 Uber 重新返台，但台灣子公司的欠稅問題仍未解決。目前 Uber 在台登記包括 Uber Eats 叫餐服務與一般叫車服務。國稅局表示， Uber 在台子公司台灣宇博已確定 2 張稅單、欠稅 1.35 億元，國稅局將繼續追討，且還有 2 張稅單在行政救濟階段。國稅局強調，即使 Uber 母公司來台登記稅籍，但原先子公司台灣宇博的 2 億元欠稅問題仍未解套。
回顧 Uber 欠稅案，最早來自於 Uber 在台灣的分公司「台灣宇博」申報營業稅與國稅局認知不同， Uber 認為自己單純從事叫車服務，因此僅需付資料處理佣金手續費，但國稅局認定 Uber 在台營業是有實質的載客商業行為，應該按照申報顧客交易的營業稅繳納。在雙方認知差異下， Uber 逾 7 成營業稅沒有報繳。由於國稅局追稅期限只有 5 年，為了避免 Uber 從 2013 年以來營運所漏稅逾期無法追繳，國稅局近年來連續向台灣宇博發出 4 張稅單，追稅期限拉長，裁罰也加重。
據財政部資料，Uber 的第 1 張稅單是 2013 年 9 月至 2015 年 8 月，所漏本稅為 900 萬元並加罰 1.5 倍罰鍰，連補帶罰共 2300 萬元；第 2 張稅單則是 2015 年 9 月至 2016 年 11 月，所漏本稅為 4500 萬元，同樣罰 1.5 倍，連補帶罰共 1.12 億元。第 3 張稅單則是台北國稅局在 5 月 2 日對 Uber 發出的最新追稅單，要求 Uber 補稅逾 5 千萬元，累計 Uber 在台欠稅金額將近 2 億元。第 4 張則在 6 月開出，針對 Uber 1 月底至 2 月初的十天營運時段，補稅金額官員不願透露，目前初估 4 張稅單共計約 2 億元。
據財政部表示，第 1 張稅單開出已久，繳稅期間已過 30 天且宇博仍未繳稅、也已過複查期限，因此依照行政執行程序，扣押台灣宇博在台存款 1 千萬元、限制台灣區負責人出境等；而第 2 張稅單部分， Uber 已申請複查，但財政部駁回，也已進入追討稅款階段。至於第 3 、4 張稅單，目前仍在行政救濟階段。
