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吳斯懷也透露，他知道國防部已經調集一批人給衡山指揮所、空軍作戰司令部，若一大批人在指揮中心這樣密閉的空間，假設疫情爆發，國防部有沒有遷移指揮所的規劃，「假如群聚感染發生，我們那麼多營區群聚在一起，有沒有完整配套？重大感染隔離，軟硬體需要預算，請問預算在哪？行政院有沒有考慮動用預備金？以及遷移到預備指揮所，通信電子的檢整，國防部應該要有完整配套計畫送交行政院。」
而在選前，吳斯懷遭質疑立場過度傾中，媒體問他是否希望台灣能加入WHO（世界衛生組織），吳斯懷說「我跟著黨團共識。要求大陸讓台灣加入WHO，不能用幾句話帶過，防疫是不可以跟政治牽扯，這是全球問題，另外不管大陸有沒有隱匿剛開始疫情，我相信時間到很多事情會浮出檯面，這沒辦法用政治力遮掩，不如開誠布公跟全世界公告。」
在選後，吳斯懷也被視為是國民黨敗選主因，黨內議員羅智強更希望吳能辭不分區，對於自己首戰表現，吳斯懷顯得相當低調，僅表示配合黨團運作，軍事是他的專業，今天就來提出建議。但在受訪完要離開黨團記者室時，他跟記者聊天時仍強調「我每天七點半就來了，五點半才走，很規矩的！」
