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當時八芝蘭（士林）一帶文風鼎盛，台灣總督府學務部特別從大稻埕搬到芝山巖惠濟宮，並在後殿開設芝山巖學堂，也就是現在士林國小的前身。招收國語傳習生，負責日語的推廣普及。並從日本招募老師來台教書，使此地成為日治時期台灣教育的發祥地。
1895年12月31日，芝山巖學堂的六位老師，楫取道明（39歲）、關口長太郎（38歲）、井原順之助（24歲）、中島長吉（27歲）、桂金太郎（27歲）、平井數馬（18歲），原本要到台北城內總督府跨年慶祝元旦，途中遇到暴動便返回學堂。卻又碰上抗日人士而慘遭斬首。（另一說則是遭到土匪搶劫而被殺害），這就是芝山岩（巖）事件的由來。
台灣總督府下令追查兇手予以懲處，撫卹受難者家屬，芝山巖學堂也因此停課三個月。將六位老師的骨灰安葬於芝山岩（巖）山頂，舉辦追思典禮。並設立「學務官僚遭難之碑」由總理大臣伊藤博文親自撰寫碑文。幾年之後又在六氏先生墓附近設立「台灣亡教育者招魂碑」與「故教育者姓名碑」。1929年芝山岩神社落成，其後每年2月1日的例祭，都會由士林公學校全體師生唱頌六氏先生之歌紀念他們。
二戰結束後，芝山岩神社、六氏先生墓和紀念碑都被破壞搗毀。神社原址改建為雨農閱覽室。1980年代芝山岩不再是軍事管制區後，許多歷史文物開始受到重視。在當地民眾及各界人士的協助下，先是在士林國小百年校慶時，重立六氏先生墓，接著再把「學務官僚遭難之碑」、「台灣亡教育者招魂碑」、「故教育者姓名碑」逐一復原。
每年芝山巖惠濟宮中元普度，除了祭祀漳泉械鬥而死的亡者，也會特別超渡六氏先生，希望祂們吃飽喝足，放下仇恨，好好安息。
資料來源：
芝山文化生態綠園－六氏先生墓
日治時期發生的芝山巖事件
六氏先生
芝山岩事件
