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林應然指出，5至11歲幼童是否接種疫苗有兩派討論，一派認為年輕族群若是確診新冠肺炎，通常症狀輕微或是無症狀，類似於一般感冒，且接種新冠疫苗後，可能產生心肌炎等副作用傷害身體，因此應思考打疫苗的目的何在，是否真有利益。
另外一派則認為，孩童並非單獨存在於社會中，也是傳染鏈的一員，即使孩童確診不會造成自身重大傷病，但仍會傳染給家中的老年人等，或是增加民眾染疫機會，若不讓孩童施打疫苗，群體免疫難以達成。
此外，林應然提到，除5至11歲幼童，連12至18歲青少年是否接種都還有許多爭議，有些國家因為擔憂青少年接種次劑心肌炎風險高，僅施打一劑新罐疫苗，因此就算是要仿效他國，要採取哪個國家政策也都充滿爭議。他認為，過往疫苗研發需經過五至十年確認無問題才會廣泛使用，但現在因應疫情，新冠疫苗僅研發一年就取得EUA（緊急使用授權），尚未經過長期研究，還不知未來會有何問題。
林應然預測，若是召集專家投票表決，可能贊成5至11歲幼童接種新冠疫苗者較多，但也會有反對意見存在，他坦言，對於幼童族群難以明確建議是否接種，不過「年紀越大越有需求」，長者接種疫苗副作用少，還能預防重症跟死亡，接種疫苗明顯利大於弊。「年紀大的人一定要接種疫苗，當年長族群都接種疫苗後，年輕族群打不打疫苗就沒太大關係，染疫也多是輕症，即使傳染給長者，但長者已接種疫苗也可預防重症與死亡，較無問題。」
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