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第二。柯文哲說，快篩陽給予COVID-19抗病毒藥物，除了先前開放的長照機構住民，應開放以下對象大於65歲，或50-65歲，加上已公布的危險因素。若已快篩陽，且有相當程度的臨床症狀，由臨床醫師判斷後，就可快速決定是否用抗病毒藥物。「因為以我過去臨床經驗來看：醫生診斷（diagnosis)和臆斷(impression)是不同的，因為很多疾病沒有辦法等到完全確定診斷才開始治療，所以當醫生在合理的臆斷之下就要開始治療，才不會錯失救援黃金時間。」
第三，柯文哲提醒，醫療量能不能垮，不能讓病人無法住院而造成人命損失。之前中央下達醫院要開設30%專責病床，目前許多醫院都未達標。固然過度擴張防疫專責病房會擠壓正常醫療運作，但是要嚴密監控疫情發展，適時增加防疫專責病房。
為了保存醫院的量能，柯文哲也建議全台都應開設防疫急門診，處理掉大部分的輕症確診者、住院、出院的標準要嚴格遵守，盡量保留量能、防疫專責旅館房間數要夠，方便醫院已好轉者可以下轉、或確診者不能在家照顧的狀況。
最後，柯文哲認為現在確診人數太多，疫調已經停止，全部改為用中央系統，讓確診者自主回報，但接觸者的居家隔離管制已經失去意義(因為都是由確診者自己疫調上傳，非疫調專業，再加上中央自主回報系統 一直塞車或沒有防呆機制、頻頻卡關)，民眾無法成功回傳資料，接觸者也拿不到居隔書，導致地方政府要重新處理，反而造成大量的行政人力浪費。所以要有務實的管理方案。
