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對於何時指揮中心可以解散，李秉穎分析，「就是當我們不再需要統計所有確診人數的時候，或者是當你新冠感染嚴重程度是小於流感的時候」，流感仍然比其他呼吸道疾病傷害更大，不過依據法訂傳染病規定，流感僅需通報重症個案，不會在意全台感染流感人數，等到新冠肺炎弱化以後也可比照辦理，只是目前台灣仍需要統計新冠個案數等資料，以利調整防疫政策。
李秉穎進一步指出，現行台灣還需要維持新冠肺炎法定傳染病等級，通報輕症等個案，未來等到新冠肺炎嚴重程度比流感低，就可以考慮降低新冠肺炎與指揮中心等級，預估還要再幾個月。
值得注意的是，李秉穎坦言，近期計算確診新冠兒童死亡率仍高於流感，因此新冠肺炎若要調降與流感等級相同，仍需要一段時間，可能會持續到明年，指揮中心才能撤除。
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